H ενδοσκόπηση του 3ου χώρου αποτελεί μια σύγχρονη εξέλιξη της ενδοσκόπησης του γαστρεντερικού σωλήνα (οισοφάγος, στομάχι, παχύ έντερο). Κλασσικά, οι ενδοσκοπήσεις (γαστροσκοπήσεις, κολονοσκοπήσεις) εκτελούνται στον αυλό του γαστρεντερικού σωλήνα που ονομάζεται 1ος χώρος. Οι ενδοσκοπήσεις όμως του 3ου χώρου διενεργούνται μέσα στο τοίχωμα του γαστρεντερικού σωλήνα και μάλιστα μέσα σε μια σήραγγα (τούνελ) που φτιάχνεται τεχνητά κατά μήκος και μέσα σε αυτό. Αυτό το καταφέρνουμε με ειδικά μικροσκοπικά νυστέρια που διέρχονται μέσα από τα ενδοσκόπια.
Γιατί όμως χρειαζόμαστε αυτή την τεχνική που επιτρέπει στα ενδοσκόπια να «κυκλοφορούν» στο τοίχωμα και όχι στον αυλό ενός σπλάχνου; Γιατί πολύ απλά μόνο έτσι μπορούμε να προσπελάσουμε την εσωτερική στιβάδα του τοιχώματος του οισοφάγου, του στομάχου ή του παχέος εντέρου και να κάνουμε κάποιες επεμβάσεις διατηρώντας όμως άθικτη την εσωτερική αλλά και την εξωτερική επιφάνειά τους (επιφανειακές στιβάδες). Μπορούμε π.χ. να αφαιρέσουμε έναν όγκο που βρίσκεται μέσα στο τοίχωμα του στομάχου. Επίσης να «χαράξουμε» κατά μήκος τον κυκλικό μυ στο κατώτερο τμήμα του οισοφάγου ώστε να τον χαλαρώσουμε όταν βρίσκεται σε σταθερή σύσπαση. Αυτό κάνουμε για παράδειγμα στην αχαλασία του οισοφάγου με μια τεχνική που λέγεται POEM.
